医学部拥有直属附属医院3所：西安交通大学第一附属医院、西安交通大学第二附属医院、西安交通大学附属口腔医院。

非直属附属医院11所：陕西省人民医院、西安市中心医院、西安市第四医院、西安市儿童医院、西安第九医院、西安市红会医院、西安高新医院、陕西省肿瘤医院、西北妇女儿童医院、西安市第八医院、西安市精神卫生中心。

社区卫生服务中心9所：西安市雁塔区电子城社区卫生服务中心、西安市雁塔区电子城二十所社区卫生服务中心、

西安市雁塔区长延堡航天社区卫生服务中心、西安市雁塔区鱼化寨社区卫生服务中心、西安市雁塔区长延堡521社区卫生服务中心、西安市雁塔区等驾坡社区卫生中心、碑林区东关南街社区卫生服务中心、西安市莲湖区桃园社区卫生服务中心。